平成１３年度に行われた認定委員会で『ジュニアマイスター』の商標登録について協議が行われ、平成１４年に全国工業高等学校長協会がこれを申請し、平成１５年３月２０日に特許庁長官より『ジュニアマイスター』の商標登録認可を戴きました。
これは現在も継続しており、『ジュニアマイスター』を含む名称を使用する時には、本協会の許諾が必要です。